Mis à jour : août 2026. Prix vérifiés sur les sites officiels.
Choisir un bon logiciel de facturation est l'une des décisions qui fait gagner le plus de temps et évite le plus de tracas à un indépendant ou une TPE. Un outil adapté transforme l'émission des factures, le suivi des dépenses et les relances client en quelque chose d'automatique, au lieu d'un tableur source d'erreurs. Et avec la réforme de la facturation électronique obligatoire, la question n'est plus optionnelle : votre logiciel doit être prêt à émettre et recevoir des factures au format structuré. Dans ce guide, nous comparons les meilleurs logiciels de facturation de 2026 pour la France avec des prix réels, un plan gratuit, les avantages, les inconvénients et le profil d'entreprise auquel chacun convient le mieux.
L'éventail est large : des outils ultra simples pensés pour l'indépendant qui ne fait que facturer, jusqu'aux suites de gestion commerciale qui combinent facturation, CRM et suivi de trésorerie. La décision ne doit pas se baser uniquement sur le prix : ce qui compte vraiment, c'est la compatibilité avec la facturation électronique, la simplicité d'usage, les relances automatiques et l'accès donné à votre comptable. Voyons cela en détail.
| Logiciel | Prix | Plan gratuit | Idéal pour | Note | |
|---|---|---|---|---|---|
| Sellsy | Dès 45 €/mois | Essai 15 jours | TPE et indépendants qui veulent facturation + CRM | ★★★★★ 4.5/5 | Voir Sellsy → |
| Henrri | Gratuit | Oui (facturation illimitée) | Indépendants qui veulent facturer simplement et gratuitement | ★★★★★ 4.4/5 | Voir Henrri → |
| Quaderno | Dès 49 USD/mois | Essai 7 jours | Activités numériques et ventes en ligne multi-pays (TVA) | ★★★★☆ 4.4/5 | Voir Quaderno → |
| Facture.net | Gratuit / dès 9 €/mois | Oui (facturation de base) | Indépendants qui débutent avec un budget minimal | ★★★★☆ 4.2/5 | Voir Facture.net → |
| Sage 50cloud | Dès 35 €/mois (approx.) | Démo sur demande | TPE et PME avec comptabilité professionnelle | ★★★★☆ 4.1/5 | Voir Sage → |
Avant de vous engager, examinez cinq critères. D'abord, la compatibilité avec la facturation électronique : en 2026, il n'est plus négociable que votre logiciel soit capable de transiter par une Plateforme Agréée dans un format structuré ; vérifiez que l'éditeur l'annonce clairement. Ensuite, le périmètre fonctionnel : si vous avez seulement besoin d'émettre des factures et de suivre vos dépenses, un outil simple comme Henrri ou Facture.net suffit ; si vous voulez CRM, suivi commercial et facturation au même endroit, Sellsy ou Sage 50cloud vous évitent de jongler entre plusieurs outils. Troisième critère, les relances automatiques et le suivi des paiements, qui font gagner des heures chaque mois. Quatrième critère, l'export comptable et la possibilité de donner accès à votre expert-comptable. Et cinquième critère, le prix réel selon votre volume et votre nombre d'utilisateurs, pas le prix d'appel.
Pour la plupart des TPE et indépendants avec un certain volume, Sellsy est le pari le plus complet car il unifie facturation, CRM et suivi commercial dans une seule suite déjà compatible avec la facturation électronique. Si vous êtes indépendant et voulez simplement facturer facilement et gratuitement, Henrri ou Facture.net offrent le meilleur rapport simplicité/prix. Et si vous vendez des produits numériques en ligne à des clients de plusieurs pays, Quaderno automatise la TVA internationale comme aucun autre.
Sellsy démarre autour de 45 €/mois (essai de 15 jours). C'est l'option la plus complète pour les TPE et indépendants qui veulent centraliser facturation, CRM, gestion commerciale et suivi de trésorerie dans un seul outil français, déjà prêt pour la facturation électronique.
Henrri est entièrement gratuit. C'est la favorite des indépendants et petites entreprises qui veulent émettre des factures professionnelles en quelques secondes sans complications, avec conformité légale et une interface très épurée.
Quaderno démarre autour de 49 USD/mois (essai de 7 jours). C'est l'outil de référence pour les activités numériques qui vendent des logiciels, formations ou infoproduits en ligne et doivent calculer et déclarer correctement la TVA dans plusieurs pays automatiquement.
Facture.net démarre gratuit / dès environ 9 €/mois. C'est l'option la plus économique pour l'indépendant qui débute et veut facturer, suivre ses dépenses et préparer sa TVA avec un plan gratuit réel et un prix payant très serré.
Sage 50cloud se situe dès environ 35 €/mois (démo sur demande). C'est l'option de référence pour les TPE et PME avec une comptabilité professionnelle et pour celles qui travaillent main dans la main avec leur cabinet comptable, avec un module comptable puissant et très implanté chez les experts-comptables en France.
La réforme de la facturation électronique obligatoire impose que les factures B2B transitent par une Plateforme Agréée (PA) dans un format structuré (Factur-X, UBL ou CII), au lieu d'un simple PDF envoyé par email. Le calendrier officiel : la réception devient obligatoire pour toutes les entreprises, quelle que soit leur taille, dès le 1er septembre 2026. L'émission devient obligatoire pour les grandes entreprises et ETI à cette même date, puis pour les TPE, micro-entreprises et indépendants au 1er septembre 2027.
Les cinq outils de ce comparatif ont déjà annoncé leur compatibilité ou sont en cours d'intégration avec les plateformes agréées, donc ce point ne devrait pas être le facteur décisif : vérifiez simplement que l'éditeur l'annonce et gardez votre logiciel à jour. Au-delà de la conformité, pensez à l'écosystème complet de votre activité : hébergez votre site et votre boutique sur un hébergement fiable, protégez l'accès à vos données fiscales avec un gestionnaire de mots de passe, et associez votre facturation à un bon CRM pour PME pour garder la relation commerciale et la facturation connectées.
Pour la plupart des TPE et indépendants avec du volume, Sellsy est le meilleur choix grâce à sa suite tout-en-un déjà compatible avec la facturation électronique. Si vous êtes indépendant et cherchez à facturer simplement et gratuitement, Henrri ou Facture.net ; et si vous vendez des produits numériques dans plusieurs pays, Quaderno automatise la TVA internationale comme aucun autre.